Le résultat opérationnel publié par Ipsen s'est élevé à 180,1 Millions d'Euros, représentant 18,5 % du chiffre d'affaires.
Ce résultat ne comprend que les redevances effectivement versées par Bayer sur ses ventes de Kogenate jusqu'à fin mai 2008, indépendamment des montants que le Groupe considère comme effectivement dus par Bayer en application de son contrat de licence. Le Groupe prévoyait de recevoir à ce titre un montant complémentaire de 25 millions d'euros de Bayer lorsqu'il a publié au mois de février 2008 ses objectifs de marge opérationnelle et sa mise à jour en août 2008 pour l'exercice.
Le résultat consolidé (part attribuable aux actionnaires d'Ipsen S.A.) s'est élevé à 147,2 millions d'euros, stable par rapport à 150,6 millions d'euros en 2007.
Le flux net de trésorerie lié à l'activité a représenté 203,4 millions d'euros en 2008, en nette augmentation comparé à 176,0 millions d'euros une année auparavant. Au 31 décembre 2008, la trésorerie nette à la clôture s'élevait à 66,2 millions d'euros, comparée à une trésorerie de 217,8 millions d'euros une année plus tôt, notamment après acquisition des actions Tercica Inc que le Groupe ne détenait pas.
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